大嶼山濕地生態地圖

深屈位於大嶼山西北部，深屈灣水位甚淺，在潮退時可以清楚觀察泥灘和紅樹林，及這些棲地的物種，例如全球瀕危的馬蹄蟹：中國鱟 (Tachypleus tridentatus) 和圓尾鱟 (Carcinoscorpius rotundicauda)。除此之外，上游的天然河溪中能把到不少水生昆蟲，如擎爪泥甲的幼蟲 (Eulichas sp.) 及有不少具保育的物種，例如易危的廣東彎尾春蜓 (Melligomphus guangdongensis)。

大澳是一條歷史悠久的漁村，村民以捕魚和生產海鹽為生。位於鹹淡水交界位置的紅樹林，吸引大量水鳥、魚類及其他濕地動物，當中包括一種體型細小的本地保育物種 - 廣瀨妹蟌 (Mortonagrion hirosei)。此外，大澳河溪物種也相當豐富，數年前更找到本地少見的華麗彩裳粒龍蝨 (Neptosternus hydaticoides)。

二澳位於大澳的西南方，有著十分豐富的濕地生境，包括濕耕農地、沼澤、河溪、泥灘和紅樹林，多樣的生境亦孕育無數的物種，其中在河溪中可以找到具保育價值的線細鯿 (Metzia lineata)，而濕耕農地亦能找到不同種類的水生甲蟲，例如毛莖斑龍蝨 (Hydaticus rhantoides)。

梅窩自宋朝已有人定居立村，村民以產鹽、耕種和捕魚為生。梅窩淡水資源豐富，有名的大嶼山飛瀑－銀礦灣瀑布，是梅窩河流的起源，擁有多種野生淡水魚。記錄了近百種蝴蝶及蜻蜓及本港已知體型最大的蝽 - 大田鱉 (Lethocerus indicum)，還有種類豐富的兩棲及爬行動物，例如在中國脊椎動物紅色名錄評級為近危的長趾蛙 (Hylarana macrodactyla)，儼如一個自然生態的寶庫。

貝澳位於大嶼山南部，擁有大嶼山最大的淡水濕地。貝澳濕地在多年前本來是農田，但後來農業息微，農戶荒廢農田後便放生水牛。水牛吃草和在泥沼中翻滾，維持植披高度和淡水濕地面貌。濕地中能找到不同的生物，如在國際自然保育聯盟評級為瀕危的鐮刀束腰蟹 (Somanniathelphusa zanklon)、以及少數以雄性照顧後代的負子蝽 (Diplonychus rusticus) 。

水口有大量荒廢的農田，大部分農地已經漸漸變成季節性沼澤濕地，成為不少水生昆蟲、兩棲類、蜻蜓生活的地方，例如黑綠真龍蝨 (Cybister sugillatus) 及在此地發現的新物種 - 水口水纓甲 (Hydroscapha shuihau)。除了有豐富的淡水生境，水口海邊也有不同的海岸生境，例如紅樹林、潮間帶沙灘及泥灘等。

東涌是一個已發展的新市鎮，在市中心的西南面有著大嶼山中最大的一條河流 - 東涌河。東涌河的源頭於鳳凰山及大東山的河溪，有著豐富的魚類，如少見的北江光唇魚 (Acrossocheilus beijiangensis) 及弓背青鱂 (Oryzias curvinotus) 等。雖然下游一段約650米的河段早年被渠道化，但不久的將來將會活化成河畔公園。